Την εταιρεία διοικεί το Διοικητικό Συμβούλιο που αποτελείται από εννέα (9) συμβούλους, μετόχους ή μη. Οι σύμβουλοι είναι πάντοτε επανεκλέξιμοι και ελεύθερα ανακλητοί. Τα μέλη του Δ.Σ. εκλέγονται από τη Γενική Συνέλευση και για θητεία, η οποία δεν υπερβαίνει τη θητεία των Δημοτικών Αρχών. Εξαιρουμένου του Πρόεδρου, ο Διευθύνων Σύμβουλος της Εταιρείας και τα εκτελεστικά μέλη του διοικητικού συμβουλίου, όπως ορίζεται στο οικείο καταστατικό, δεν μπορεί να είναι αιρετοί εκπρόσωποι των δημοτικών ή περιφερειακών συμβουλίων των μετόχων ΟΤΑ. Ο Δήμος Αλεξανδρούπολης ορίζει τα επτά (7) μέλη του Δ.Σ., ο Δήμος Σουφλίου ορίζει ένα (1) μέλος του Δ.Σ. και ο Δήμος Σαμοθράκης ένα (1) μέλος του Δ.Σ.
Η σύνθεση του Διοικητικού Συμβουλίου έχει ως εξής:
Πρόεδρος
- Ιωάννης Ζαμπούκης, Δήμαρχος Αλεξανδρούπολης
Αντιπρόεδροι:
- Παναγιώτης Καλακίκος, Δήμαρχος Σουφλίου
- Αθανάσιος Βίτσας, Δήμαρχος Σαμοθράκης
Διευθύνων Σύμβουλος:
- Τατούλη Παρασκευή, Νομικός με ειδίκευση στην περιφερειακή Ανάπτυξη/ Εκτελεστικό Μέλος
Μέλη:
- Γεώργιος Κουκουράβας, Πολιτικός Μηχανικός
- Γεώργιος Παζαρλιώτης, Πολιτικός Μηχανικός
- Σπυρίδων Καραλής, Νομικός
- Μαγδαλινή Μιχαλίτση, Λογίστρια
- Ιωάννης Ναϊτίδης, Αντιδήμαρχος Δήμου Αλεξανδρούπολης
